La virologie fondamentale est à module qui consiste à explorer et l’étude de la diversité du monde des virus est appréhendée au plan de leur structure, de leur cycle de multiplication, de leur interaction avec l’hôte (homme, mammifère, plantes, etc..) ainsi que de leur mode de transmission et de diffusion. Les aspects épidémiologiques ainsi que les facteurs de risque et les mécanismes d’émergence sont également abordés. Les conséquences fonctionnelles de l’infection virale sont évaluées tant au niveau cellulaire qu'au niveau de l'organisme entier grâce à une vision intégrative faisant appel à des disciplines complémentaires (biologie moléculaire, génétique, génomique, biologie cellulaire, immunologie, écologie). Cette approche holistique de la pathogenèse virale est déclinée en médecine humaine (VIH, HTLV, rotavirus, virus des hépatites, arbovirus, herpes virus, papillomavirus, virus grippaux, virus rabique) mais aussi vétérinaire (zoonoses), aux plans clinique, thérapeutique et prophylactique.